Em meados de 2018, o Botafogo-SP se tornou uma S/A em busca de garantir investimentos. Esportivamente, o time conquistou o acesso para a Série B logo no primeiro ano, mas logo depois o time não conseguiu mais repetir tal boa fase. Em três temporadas completas sendo um clube-empresa, a equipe tricolor ainda não conseguiu um aproveitamento acima dos 50%.
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No ano em que disputou a Série B do Brasileirão, a equipe quase amargou um rebaixamento no Campeonato Paulista. Com a chegada de Roberto Cavalo durante a competição, o time escapou da degola na última rodada e garantiu mais um ano na elite estadual. Na Série B, o time teve um bom começo, mas perdeu fôlego e com o comando de Hemerson Maria na reta final, o time terminou em nono lugar, permanecendo na Segundona. Ao fim do ano, o time terminou com 40,3% de aproveitamento.
Em 2020, em ano de pandemia, a equipe de Ribeirão Preto começou a temporada com Wagner Lopes no comando e no decorrer acabou trocando para Claudinei Oliveira. Com o acúmulo de jogos em poucos dias, o time brigou para não cair novamente, mas conseguiu sobreviver. Mas no Brasileiro, o time não conseguiu impedir o descenso. No fim, o aproveitamento foi de 31,4%.
Foto: Caio Marcello/AGIF – Botafogo-SP terminou em sétimo lugar do Grupo A na Série C
Neste ano, mais trocas de técnicos e luta para não cair no estadual. O time começou muito mal no Paulistão com um empate e quatro derrotas nos primeiros cinco jogos. Com a troca de Alexandre Gallo para Argel Fuchs, o time se manteve na Série A1 do Campeonato Paulista. Já na Série C, o time não conseguiu o objetivo de subir para a Segundona, terminando em sétimo lugar do Grupo B. E terminou na Copa Paulista, com o jovem Samuel Dias, como vice, perdendo para o São Bernardo.
O aproveitamento foi um pouco maior, com 44,1%, mas foi o terceiro ano seguido abaixo dos 50%. Em 2022, o técnico será Leandro Zago, que tem a missão de reformular o elenco que disputa o Campeonato Paulista e a Série C do Campeonato Brasileiro. A estreia da equipe será no dia 26 de janeiro contra o Santo André, no estádio Santa Cruz, em Ribeirão Preto.
