Vale destacar que esquipes como Mirassol, Vitória e CRB buscaram juntamente com o Peixe o empréstimo do defensor, mas a diretoria paulista tinha como prioridade uma transferência internacional. A proposta enviada pelo Portimonense foi debatida durante reunião do Comitê de Gestão no dia 15 de novembro, sendo aprovada.

Revelado nas categorias de base do Santos, o zagueiro estreou na equipe profissional em 2019 com o técnico Jorge Sampaoli, onde atuou na goleada diante do América-RN por 4 a 0, em partida disputada no Pacaembu, pela Copa do Brasil. Wagner Leonardo se tornou opção para a zaga em 2019 e 2020, sendo utilizado, inclusive, como lateral-esquerdo por Cuca.

O defensor foi fundamental para a equipe na luta contra o rebaixamento no Campeonato Brasileiro de 2021, onde marcado o gol da vitória diante do Grêmio, nos acréscimos. Esse confronto foi fundamental para que a equipe ficasse fora das últimas colocações na competição. Mas, na equipe teve diversas oscilações, não conseguindo se firmar na posição.