Rafael fez sua base inteira com a camisa do Paraná e fez sua primeira partida como profissional em 2016 com 17 anos. O jogador foi mais aproveitado nos anos de 2019 e 2020, após curta passagem pelo sub-20 do Atlético-MG. Nas duas temporadas, ele acabou passando zerado e foi pouco aproveitado no elenco que, por exemplo, caiu para a Série C em 2019.

Após o Paraná, o jogador foi para o futebol europeu e defendeu as cores do Académica OAF, tradicional equipe portuguesa, que atualmente está na segunda divisão do país. Foram 15 partidas e apenas um gol marcado. De saída do time europeu, ele voltou ao Brasil e defendeu o Boston City Brasil, filial do time americano em nosso país. Foram seis gols em nove jogos na Segundona do Campeonato Mineiro.

Entre os reforços para o sistema defensivo estão Mateus Anderson, ex-Mirassol, Matheuzinho, ex-São Bernardo, e o experiente Walter, que atuou na última temporada pelo Botafogo-SP. Em 2022, o Tricolor disputa a Série D do Brasileiro e o Campeonato Pernambucano apenas, já que ficou de fora da Copa do Brasil e também da Copa do Nordeste.